FunDive og Svampeatlas - sekvensering af svampe i 2024

Flittige læser af Svampeforeningens tidsskrift Svampe  har nok bemærket at Danmarks Svampeatlas nu er del af et Europæisk forskningsprojekt FunDive, hvor vi meget gerne vil have jeres bidrag.

Helt konkret drejer det sig om seks forskellige projekter, som alle handler om at anvende DNA sekvensering til at gøre os klogere på Europas svampe, deres diversitet og beskyttelsesbehov. De fem projekter handler om:

1. Stjernebolde (Geastrum)
   
2. Stilkbovister (Tulostoma)
   
3. "Most wanted" - diverse sjældne eller dårligt kendte bugsvampe, herunder ager-bovist (Bovista graveolens), kær-støvbold (Lycoperdon caudatum) pindsvine-støvbold (L. echinaceum), hede-støvbold (L. echinaceum), rosa støvbold (L. mammiforme), pælerod-støvbold (L. radicatum) og sand-bruskbold (Scleroderma septentrionale).
   
4. Slørhatte, ridderhatte og brunsporede pigsvampe i fyrreskov
5. Netbladhatte med arter af el
6. Udvalgte arter af svampe som mangler en type (se detaljer nedenfor)
   

I alle seks projekter er vi MEGET interesserede i veldokumenterede tørrede indsamlinger, som du enten kan melde ind i Danmarks Svampeatlas (præcis som du plejer) eller via appen PlutoFGo som kan downloades til både iPhone og Androd via de sædvanlige kanaler. Det tørrede materiale kan derefter (forsvarligt emballeret) sendes til Jacob Heilmann-Clausen, Københavns Universitet, Globe instituttet, Universitetsparken 15, bugn 3, 2100 KBH Ø (eller overbringes til mig eller Thomas Læssøe på anden vis)

 Du kan læse mere om de fem øverste projekter her: https://fun-dive.eu/get-involved/current-projects/ eller i seneste nummer af Svampe (se PDF her: https://drive.google.com/file/d/17ssMy3CiGFDbgqJ-KdLjx9YJctdcqTpw/view?usp=drive_link). 

To af projekterne er dog ikke beskrevet i Svampe da de først er lanceret efter deadline, så hold øje med FunDives projekthjemmeside - der kan komme flere projekter allerede i år!  

Det sidstnævnte projekt (nr 6) fortjener lige lidt flere detaljer. Her er pointen at dokumentere svampe som oprindeligt er beskrevet videnskabeligt fra Danmark, men som mangler en såkaldt type-indsamling. Det drejer sig om følgende arter: 

Clavulina cristata	kam-troldkølle
Coprinopsis cortinata	slør-blækhat
Cortinarius pseudosalor
Cuphophyllus lacmus	gråviolet vokshat
Entoloma xylophilum
Inocybe griseolilacina	lillagrå trævlhat
Lacrymaria pyrotricha	ildhåret mørkhat
Lepiota setulosa
Lepiota subincarnata	kødfarvet parasolhat
Lepiota tomentella	filtet parasolhat
Lepista sordida	liden hekseringshat
Mycenella margaritispora	stjernesporet dughat
Omphaliaster asterosporus	narrehat
Pluteus cinereofuscus	gråbrun skærmhat
Thaxterogaster microspermus	småsporet slørhat
Tubaria mimina
Tulosesus bisporus	tosporet blækhat

Der er med andre ord mange muligheder for at bidrage, lige meget om du drager ud i den nærmeste fyrreskov eller går på jagt efter bugsvampe eller dine favoritter på listen ovenfor. Vi er derudover stadig interesserede i indsamlinger af mange andre svampe, fx trævlhatte, men har i øjeblikket ikke ressourcer til at få dem sekvenseret.

God Jagt -på vegne af atlasgruppen!

 

Nøgler til nogle bægersvampe

Der ligger nu nye nøgler til slægterne skjoldbæger (Scutellinia) og ørelæger (Otidea) på svampeatlas – bare reload siden med links til nøgler, så kommer de frem nederst: http://www.mycokey.com/Bestemmelseshjul/bestemmelseshjulBasiLinks.html

De dækker tempereret Europa og er på engelsk.

 Op til sæsonen 2024 er det endelig lykkedes at få bogen Danmarks basidiesvampe udgivet. Den udnøgler over 4700 arter af basidiesvampe og er en moppedreng på 872 sider. Køb den hos Svampetryk.

Det betyder imidlertid ikke at vi er færdige med at arbejde på nøglerne.

Dels er der grupper, hvor der stadig komme nye store udredninger af artskomplekser og her vil vi prøve at følge op med nye versioner af nøglerne. Der er fx lige uploaded en ny udgave af nøglen til fluesvampe.

Dels arbejder Thomas Læssøe og Jens H. Petersen på nøgler til de mere iøjnefaldende sæksvampe, se denne nøgle til morkler, stenmorkler og foldhatte. Disse nye nøgler er skrevet på engelsk, så de kræver nok lidt tilvænning. Vi forsøger imidlertid at bruge et let tilgængeligt engelsk og nøglerne er iøvrigt ligesom de tidligere atlasnøgler illustrerede, så man er godt hjulpet :-)

ITS sekvensdata er nu publiceret og søgbare i Danmarks Svampeatlas

Som mange faste brugere af Danmarks Svampeatlas ved, har vi de sidste fem år anvendt DNA-sekvensering som et værktøj til at identificere interessante indsamlinger af svampe. Dette har medført at mere end 350 svampearter er blevet tilføjet til tjeklisten over Danmarks svampe, heraf næsten 150 arter af slørhatte, mere end 60 trævlhatte og godt 40 rødblade. Dertil kan tilføjes yderligere en række ubeskrevne arter, hvoraf nogle, hvis alt går vel, vil blive beskrevet i en videnskabelig artikel indenfor det næste års tid. 

De mange sekvensdata er nu tilføjet til de relevante funddata i Danmarks Svampeatlas, og kan fremsøges ved at vælge "fund med DNA sekvenser" allernederst i søgeformularen. Her er et eksempel, i form af en søgning med alle slørhatte med sekvensdata: https://svampe.databasen.org/search/551

Selve sekvensdata findes allernederst på fundsiden, og består af bogstaverne A, C, T og G svarende til de fire baser i DNA. Det siger ikke meget i sig selv men kan bruges til at sammenligne med publicerede DNA sekvensdata i Genbank, Unite og andre internationale databaser der samler den slags data. Knappen blast/Unite giver i princippet mulighed for at lave en sådan sammenligning med data i Unite, men mangler en opdatering.    

Vi er i øjeblikket ved at få analyseret et nyt batch af indsamlinger, som vi med stor spænding forventer at få resultater for i løbet af foråret. Der vil stadig være mulighed for at indsende indsamlinger til sekvensering i 2024, men efter alt at dømme med et mere snævert fokus. Det kommer der mere om inden sæsonen!  

Højsæson for svampejagt i trækronerne

Den overskrift lyder nok lidt underlig, men skal du på svampejagt i wekeenden, så er det oplagt at eftersøge svampe og lav der vokser på tynde grene og kviste i trækronerne højt over skovbunden.

Det kræver blot en meget lang stige, eller at du er smart og kigger efter de mange grene som er blæst ned af vinterens storme eller som er knækket på grund af tung tøsne. På disse grene kan du finde et udvalg af laver og vedboende svampe som typisk danner deres frugtlegemer højt over skovbunden. Det drejer sig bl.a. om kernesvampe, skivesvampe, barksvampe og bævresvampe. Mange af disse er endofytter eller såkaldte hvilende nedbrydere som lever inde i træernes grene mens de stadig er levende, men som først udvikler sig når grenene dør

Årets vindere!

 

På Svampedagen i går i København, blev årets vindere af konkurrencerne i Danmarks Svampeatlas kåret:

 

Årets slider (flest fund totalt): Jane Nielsen

Årets hitjæger (flest fund af rødlistede arter, med bonus for fund i nye kvadrater: Uffe Harboe Nygaard

Årets højdespringer (flest nye arter på den personlige liste: Mathias Hass

Årets fornyer (flest fund af nye kvadrat-arter): David Boertmann

Årets arkivar (flest gamle fund indtastet: Morten Strandberg

Årets validator (størst indsats for at stemme andre brugeres fund hjem): Karen Poulsen

 

Og sidst, men ikke mindst, årets fund med 78 stemmer, Nordisk gyldenblad (Chrysomphalina chrysophylla) fundet af Jannick Pajhede i Tornby Klitplantage 27 juli. Afstemningen var særligt tæt i år

Årets Svampefund 2023 - afstemning

 

Tretten svampefund, fjorten findere, inklusiv en trøffelhund! Nominerings-runden er nu ovre og det er på tide at stemme om Danmarks bedste svampefund 2023. Og denne gang kan man stemme på alt fra lyse pletter på åkander, næsten usynlige belægninger på fyrrestubbe og mosparasitter, til kuriøst formede laver, til nye danske poresvampe og flot farvede hatsvampe.

Der er mange gode kandidater, men der er kun plads til én vinder! Som sædvanlig foregår afstemningen ved at man som aktiv bidragyder til Danmarks Svampeatlas kan afgive maksimalt ti point, til et eller flere af de nominerede fund. Man bestemmer helt selv, hvordan man fordeler sine stemmer på de svampe man synes har fortjent det.

Afstemningen foregår ved at sende en e-mail til jheilmann-clausen@sund.ku.dk med sine point. Sidste frist for at afgive stemmer er 19 februar! 

Se hele listen med begrundelser mv her: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1w3l0ggVSYL6SkOBHNHNqpnMWFUTHFOWgIn1YobKxoWs/edit#gid=0):

Fund	Art (latin)	Art (DK navn)
DMS-10341387	Rigidoporus cuneatus	Japangran-trylleporesvamp
DMS-10359593	Chrysomphalina chrysophylla	Nordisk gyldenblad
DMS-10408246	Dentipellis fragilis	Pighud
DMS-10359035	Faerberia carbonaria	Kulkantarel
DMS-10412699	Helicogloea subardosiaca
DMS-10401349	Lamprospora tuberculata
DMS-10382872	Leucogaster nudus	Kammertrøffel
DMS-10340582	Mycena cyanorrhiza	Blåfodet huesvamp
DMS-10354369	Nephromopsis cucullata	Kræmmerhus-kruslav
DMS-10373037	Phlegmacium saginum	Brunbæltet slørhat
DMS-10378384	Rhamphospora nymphaea
DMS-10402741	Stereopsis reidii
DMS-10362137	Trametopsis cervina	Frynseporesvamp