25.04.2017

Interaktiv validering - bagom systemet

Siden februar har Danmarks Svampeatlas gennemgået en række større forandringer med fokus på at inddrage bruger-kompetencer så langt det er muligt. Systemet er nu indrettet sådan at det inddrager alle de kompetencer vores brugere har – og ikke længere kun på nogle få udvalgte eksperter med  validator-rolle. I det gamle system kunne man kommentere på andres fund og bestemmelser – nu kan alle være aktive i forhold til at foreslå bestemmelser på indlagte fund og ved at stemme for andres forslag. Det hele i et interaktivt system som vi håber I vil tage godt i mod . Vi har forsøgt at gøre det nye system attraktivt og nemt at tilgå ved at lave et valideringsbånd øverst på startsiden, hvor man kan se fund med fotos der har brug for stemmer for at blive godkendt. Fund uden fotos der mangler stemmer skal fremsøges vha. de sædvanlige knapper.


I det nye system skelner vi mellem fund og bestemmelser:

Et fund vedrører en observation af en arts-forekomst (typisk et mycelium med frugtlegemer) på en lokalitet en bestemt dag. Der kan godt være mere end én finder på et fund, hvis man er på tur sammen. Dette kan angives både når man lægger fundet ind, men også efterfølgende, hvis man trykker på det lille ”+” ved ”findere” på fundvisningen. Man kan også tilføje fotos til fund der allerede er lagt ind af andre. Vi anbefaler stærkt at hvert fund fra en fælles tur kun indlægges én gang – det giver meget mere pålidelige data. Ser man den samme art  (fx en sjælden art) på flere mycelier eller på forskellige træarter, må i fortsat meget gerne lægge flere fund ind fra den samme tur og klart angive at det drejer sig om forskellige mycelier.

En bestemmelse er et bud på hvilken art et fund repræsenterer. Et fund kan godt have mere end en bestemmelse. Den første bestemmelse kommer typisk fra den person der lagt fundet ind, måske som ”ubestemt svamp”, mens senere bestemmelser kan tilføjes både af finderen selv og alle andre registrerede brugere. De forskellige bestemmelser tildeles en sandsynlighed baseret på en række forhold som beskrives nærmere nedenfor. Den bestemmelse som har den højeste sandsynlighed vises som den gældende. Når man kommer med bud på en bestemmelse kan man angive hvor sikker man er i sin sag.

·         Jeg er helt sikker - bruger din score i gruppen + tillæg for hvert godkendt fund du har i gruppen
·         Det er sandsynligvis denne art - giver 90% af din score, men uden tillæg for godkendte fund
·         Det er muligvis denne art - giver 50% af din score, men uden tillæg for godkendte fund

Man kan ændre den angivne sikkerhed efterfølgende på fundvisningen, fx hvis man har tjekket sit fund mod den store svampebog eller  i mikroskopet efter at være kommet hjem fra svampeturen

En stemme er din mulighed for at erklære dig enig i en allerede foreslået bestemmelse. Man aktiverer sin stemme ved at trykke på ”thumps up” symbolet under ”bestemmelser”, hvorefter symbolet skifter farve fra sort til grøn. Fortryder man, trykker man på symbolet igen og det skifter tilbage til sort. Når man stemmer på andres bestemmelser vil man opleve at det i nogle tilfælde øger sandsynligheden af bestemmelsen. I andre tilfælde sker der ingen ændring. Forklaring følger nedenfor.
Enhver forslået bestemmelse tildeles en sandsynligheds-score baseret på en række kriterier der knytter sig dels til den forslåede art og den bruger der foreslår bestemmelsen:

Denne score kan opnå værdier mellem 1 og 100. I søgeresultater vises sandsynligheds-scoren i tre overordnede kategorier:
·         Godkendt (score over 80)
·         Sandsynlig (score mellem 50 og 80)
·         Forslag (score mellem 1 og 50)

I beregningen indgår:

·         Artens sjældenhed baseret på hvor mange fund der i forvejen findes i databasen (”taxon-vægt”).
·         Den geografiske udbredelse for arten (”geografisk modifikator”)
·         Artens fænologi (”årstids-modifikator” f.eks. vil mange mykorrhiza-svampe få en lav sandsynligheds-score om foråret)
·         Brugerens tidligere godkendte fund af arten (”bruger-arts-score”)
·         Brugerens generelle erfaring i artsgruppen (”bruger-formgruppe-score”)
·         Hvor sikker brugeren mener bestemmelsen er (se ovenfor)

Når man stemmer på en allerede foreslået bestemmelse er det kun de tre nederste scorer der indgår. Hvis du stemmer på en art du aldrig tidligere har indlagt godkendte fund af, og som tilhører en formgruppe, hvor du heller ikke har fundet andre arter, er din score 0. I dette tilfælde har din stemme derfor ingen effekt på sandsynlighedsscoren. Omvendt har din stemme stor vægt i en gruppe, hvor du har mange godkendte fund i atlas.  Alle scorer, vægte og modifikatorer beregnes dynamisk baseret på data i Svampeatlas, og lægger du fund ind som efterfølgende godkendes ændres din personlige score hurtigt. Systemet gør at du automatisk får mere og mere vægt i de svampegrupper du er interesseret i og har forstand på. Kigger du fx meget på skørhatte og har mange godkendte fund af mange arter får du meget større vægt når du foreslår alternative bestemmelser eller stemmer på andres.  Der er i øjeblikket defineret mere end 100 formgrupper af svampe i Danmarks Svampeatlas. Vi er ikke 100 % færdigt med at afgrænse disse formgrupper (især sæksvampene er en stor opgave), og de kan indtil videre kun findes hvis man forsøger sig lidt frem i ”valideringsbåndet” øverst i gallerivisningen når man logger ind på svampeatlasset.

Det nye system betyder, at det er ukonstruktivt at antyde at folks bestemmelser er forkerte i kommentarerne til de enkelte fund. Det kan virke demotiverende for mange af de nye kræfter vi gerne vil have sat i spil. Det er meget bedre at foreslå en alternativ bestemmelse, gerne med en konstruktiv kommentar, som kan gøre folk klogere. Men brug meget gerne stadig kommentarfeltet til at bede om yderligere oplysninger om fundene, hvis dette kan hjælpe med en sikker bestemmelse.

Vi arbejder stadig med justeringer af systemet, så har du input hører vi meget gerne om det - send meget gerne en email til jheilmann-clausen@snm.ku.dk


På vegne af atlasgruppen


30.03.2017

Svampeatlas offline fra kl 23 i aften til fredag kl 12 pga opgradering

Fra i aften torsdag d. 30.3 kl 23 og til i morgen fredag d. 31.3 kl 12 vil svampeatlas være offline. Der kommer en opdatering i morgen som kræver en større data-processering som køres i nat.

27.03.2017

Svampeatlas - nu med interaktiv validering

Som nogle af jer sikkert har bemærjet, har vi I løbet af de sidste to uger lanceret et helt nyt koncept for fund-validering i Danmarks svampeatlas, hvor alle brugere kan give deres besyv med. Det har været et stort arbejde at udvikle systemet, og vi har været meget spændte på hvordan det ville fungere i praksis. Den sidste uge har vist at systemet - sagt på godt jysk - fungerer rimelig godt, selvom der endnu er nogle mærkværdigheder at rette op på. Og flere kommer sikkert til efterhånden som vi lærer systemet bedre at kende.

I det gamle system var alle arter kodet med krav til validering: Nogle arter gik glat igennem uden krav til dokumentation, mens andre krævede fotos, beskrivelser, eller at man sendte tørret materiale til tjek hos en af eksperterne i projektet. Det sidste var et levn fra det gamle Svampeatlas (som kørte i perioden 2009-13), hvor vi havde ressurcer til at tjekke tusindvis af tørrede svampe. I det nye system får en bestemmelse automatisk en sandsynligheds-score på mellem 1 og 100 baseret på artens sjældenhed og forekomstmønster, samt brugerens erfaring med den aktuelle art og artsgruppe. Siden kan andre brugere erklære sig enige i den foreslåede bestemmelse, og dermed øge sandsynlighedsscoren, eller de kan komme med et alternativt bud på en bestemmelse. Man kan også selv komme med alternative forslag til bestemmelse af egne fund. I det nye system kan hvert enkelt fund med andre ord have flere konkurrende bestemmelser med hver sin sandsynlighed. Ved listevinsning på atlasportalen viser vi den bestemmelse der har den højeste sandsynlighedsscore med 1-3 stjerner:

*** Godkendt (score over 80)
** Sandsynlig (score mellem 50 og 80)
* Forslag (score mellem 1 og 50)

Hvis der findes alternative forslag til bestemmelser kan de ses, hvis man åbner det enkelte fund.

Med det nye system har vi ophævet det hårde skel mellem eksperter og brugere, og gjort valideringsprocessen interaktivt. Alle brugere kan deltage som validatorer baseret på deres erfaring, som dokumenteret ud fra godkendte fund i Svampeatlas. Vi har opdelt de danske svampe i over 100 pragmatiske grupper (eksempler er vokshatte m.fl., hatdannede poresvampe og køllesvampe), og en ihærdig bruger kan hurtigt blive ekspert i sin egen ynglingsgruppe af svampe. Vi er endnu ikke helt færdige med at definere disse grupper, især udenfor basidiesvampene, men de vil snart kunne fremsøges i atlasset. Vi har dog bibeholdt ekspertrollen foreløbigt, så vi er stadig en lille gruppe af eksperter der kan trumfe en bestemmelse igennem, fx hvis der er tale om en ny art for Danmark, stor kontrovers eller hvor systemet endnu ikke fungerer efter hensigten. En bestemmelse der er valideret på denne måde er fremhævet med et lille mikroskop, fremfor med en til tre stjerner

En hjælpevideo til det nye system kan findes her: http://quick.as/bp7qtngeg
og en mere detaljeret beskrivelse af beregingskonceptet kan læses her: https://svampe.databasen.org/validation

Vi håber I vil tage godt imod det nye system - husk at spørgsmål med fordel kan stilles i vores facebook gruppe - https://www.facebook.com/groups/svampeatlas/?fref=ts, eller som svar til dette blog-indlæg

mvh Atlasgruppen (Tobias Guldberg Frøslev Jacob Heilmann-Clausen, Thomas Stjernegaard Jeppesen, Thomas Læssøe og Jens H. Petersen)

15.03.2017

Atlasbasen lukkes i morgen 9-15

I forbindelse med en større opdatering af vores databaser og software lukkes svampeatlas for indlæg og søgning af fund i morgen mellem 9-15. Vi glæder os til at komme online igen, forhåbentligt med forbedret funktionalitet

23.02.2017

Nye og opdaterede bestemmelseshjul

Så er vinterens nye og reviderede hjul uploadet her. Der er både nye hjul til bugsvampene samt opdateringerne af resten af basidiesvampene uden lameller.



Der er også kommet mere realistiske sidetal på hjulene, fx stinksvampene, der nu ligger på side 1224 i det kommende værk.



Nu skal vi lige have layoutet sæksvampene (til side 1700), skrevet teksterne, samlet det hele, korrekturlæst og oversat til engelsk – så er vi trykklare :-)

08.02.2017

Flere arter med beskrivelse, forvekslingsmuligheder mm.

I en fælles indsats mellem Svampeatlas og Jens og Thomas' bogsatsning for Gyldendal (se her) produceres der i øjeblikket tekster til over 2000 danske arter i svampeatlas.

Allerede nu er der tekster til over 1200 arter og der skrives nye i en stadig strøm. Særlig afsnittet om forvekslingsmuligheder bør være interessant for brugerne af atlasset, idet vi her forsøger at give en kritisk bedømmelse af de problemer med som bestemmer står overfor.

Find teksterne enten via linket "Danske arter" fra indtastningsportalen eller fra forsidens link "Søg efter danske arter". Vi håber at blive færdig med første gennemskrivning til sommer.

20.01.2017

nedlukning mandag d. 23 jan grundet softwareopdatering

serveren lukker ned i tidsrummet 9-13 mandag d. 23 da Thomas SJ lige skal have opdateret diverse sager :-)